2026·em apuracao
Filiação ao Missão e registro de candidatura barrado
Ao tentar registrar a candidatura presidencial pelo PL, o senador apareceu no sistema do TSE como filiado ao Partido Missão, legenda ligada ao MBL e do candidato Renan Santos. Com dupla filiação no sistema, o PL não conseguiu concluir o registro no prazo. O Missão afirma ter sido vítima de uma filiação fraudulenta feita em seu sistema; o entorno de Flávio fala em sabotagem. O pedido de filiação usava dados de endereço manifestamente falsos, e a confirmação foi feita a partir de acesso ao e-mail institucional do gabinete.
2024–hoje·em apuracao
Proximidade com Daniel Vorcaro e o caso Banco Master
A investigação sobre o Banco Master e a prisão do seu dono, Daniel Vorcaro, expuseram a rede de contactos do banqueiro em Brasília. Reportagens apontaram encontros, apoio a eventos e proximidade política com Flávio Bolsonaro e com parlamentares do centrão, levantando dúvidas sobre influência do banco no Congresso.
2018–hoje·em apuracao
Rachadinhas no gabinete da Alerj
O Ministério Público do Rio o acusou de peculato, lavagem de dinheiro e organização criminosa pela retenção de parte dos salários de assessores do seu gabinete na Assembleia Legislativa entre 2007 e 2018.
2018–2021·confirmado
Relação com Fabrício Queiroz
Ex-policial militar, assessor e amigo próximo da família, Queiroz movimentou valores de assessores do gabinete e fez depósitos na conta de Michelle Bolsonaro.
2020·parcial
Compra da mansão em Brasília
Aquisição de uma mansão de R$ 6 milhões no Lago Sul, em Brasília, com pagamento parcialmente em dinheiro vivo.
2018–2019·parcial
Patrimônio e as lojas de chocolate
Crescimento patrimonial e a compra de uma franquia de loja de chocolates foram apontados como incompatíveis com os rendimentos declarados.
2023–2026·confirmado
Posição sobre o 8 de janeiro e a anistia
Defesa pública de anistia aos condenados pelos atos de 8 de janeiro de 2023 e minimização da gravidade dos ataques.
2022·falso
PL e o caso das urnas eletrônicas
O PL pediu à Justiça Eleitoral a invalidação de votos de urnas de modelos anteriores a 2020, alegando inconsistência de logs.